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저자정보
저널정보
대한임상검사과학회 대한임상검사과학회지 대한임상검사과학회지 제51권 제1호
발행연도
2019.1
수록면
78 - 85 (8page)

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막 단백질은 심장질환, 암과 같은 우리 주변에서 흔히 발생하는 질병에 관련되어 있다. 이러한 암과 같은 특정한 질환 상태에서, 막 단백질과 관련된 신호 전달의 비정상은 세포분열을 통제하지 못하고 증가시킬 수 있으며 막 단백질의 발현에 변화가 생긴다. 막 단백질은 지질 이중층으로 이루어진 소수성 환경을 가지고 있어 불안정하기 때문에 막 단백질을 추출해서 연구를 수행하는데 어려움이 있다. 이번 연구에서는 최적화된 막 단백질추출법을 확인하고자 서로 다른 두 가지 추출법의 효율성을 평가하였다. 두 가지 방법으로, high-speed centrifuge법과 reagent법이비교되었다. 비교 분석결과, 미토콘드리아 내막 단백질 분석에는 high-speed centrifuge법이 효율적이고, 소포체막 단백질 분석에는 reagent법이 유용함을 확인하였다. 게다가유전자 온톨로지 소프트웨어를 이용해서 추출된 막 단백질의기능분석을 진행하였을 때, 유전자 온톨로지는 reagent법에서소포체 막 단백질에 연관된 반응이 활성화 되는 것을 확인할 수있었다. 프로세스 네트워크 분석에서, high-speed centrifuge 법에서는 하나의 클러스터를 형성화는 반면, reagent법에서는네 개의 클러스터를 형성하는 것을 시각화하여 확인하였다. 결론적으로, 두 가지 분석법은 서로 다른 하위 막 단백질의 분석에유용함을 확인할 수 있었다. 이러한 결과를 토대로, 막 단백질을분석할 때, 표적의 세부 막 단백질을 고려하여 방법론을 선택하는데 도움을 줄 것으로 기대된다.
#High-speed centrifuge method #Membrane protein #Membrane protein extraction #Reagent-based method

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Wu CC / 2003 / The application of mass spectrometry to membrane proteomics / Nat Biotechnol 21:262 Crossref Tan S / 2008 / Membrane proteins and membrane proteomics / Proteomics 8:3924~3932 Crossref Xiaojun Liu / 2010 / Membrane proteomic analysis of pancreatic cancer cells / Journal of Biomedical Science 17(1):74 Crossref Paul J. Adam / 2003 / Comprehensive Proteomic Analysis of Breast Cancer Cell Membranes Reveals Unique Proteins with Potential Roles in Clinical Cancer / Journal of Biological Chemistry 278(8):6482~6489 Crossref Zhang W / 2003 / Affinity enrichment of plasma membrane for proteomics analysis / Electrophoresis 24:2855~2863 Crossref

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